생각하는 박사과정

fda) 구조모델 및 전체 모델 데이터 리키지 검증 설계

STRUCTURE MODELtrainexternal drugs (~5000)test없음 (prediction only)------------------------EXPERIMENT MODELtrain우리 80%test우리 20%------------------------FUSION MODELtrain우리 20% --이게 맞음? 구조모델에서 테스트셋은?구조 단독실험 단독Fusion 평균LR StackingBreast0.64920.50770.58460.6523Colon0.81620.48530.69120.8309결과보면, 퓨전모델 결과가 높은 것이 아닌 구조 단독모델에서 auc가 breast/colon 0.64/0.81이 나오는 것임.구조에서 리키지가 트레인/테스트셋 만 약물레벨로 나누면 되냐.. 문제인거지 ..

경정랩실의 usb(sw)

경정랩실에 256기가 바이트 뭐있나 햇는데전에 교수님이 주신건가. 23년 24년 초 에 sw가 있네.. 쩝. 오랜만에 와서 함.파일 다운이 되게 오래걸리는 중도 피시.. 재작년보다 더 안좋아진 거같은데 재작년에 이정도 아니었는데?왔고 저녁에 와서 하고 있는데 지금 엘엘엠들이 다 말을 안들음..글고 키보드도 왜케 경정이나 역학이나 계속 안먹히는지 알다가도 모르겟음 . 정말. 왜 빨리 눌려서 그런건가..? 쩝.. 내일 실험 결과 들고가야는데.. 흠.. 학습 먼저 2만개 정도 시키면 뭔가 구조모델 달라지려나 쩝.....!!! 결과를 못 보이노..

https://www.fda.gov/drugs/drug-approvals-and-databases/drugsfda-data-files Drugs@FDA Data FilesDrugs@FDA Downloadable Data File, Data Definitions,Entity Relationship Diagramwww.fda.gov 내가 이렇게 찾고 물어보니, 피티가 알려줌-프러덕트.txt 파일 : 승인 데이터-chmbl: 비승인 데이터 로 한다고 함. 1. 은 txt파일 다운완(승인데이터)2. chemdl sqlite 로 다운(비승인데이터, 용량큼) : 이게 파이썬으로 읽힌다고 함.-> max phase 1,2,3 이 non approved 임. 자주 쓰는 데이터로 승인/비승인 비율 맞춤. 실제 만들 데..

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